在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

理论研究但是

1、从光敏致力于神经元中取出DNA热塑血清质

只为分开光热塑血清质-DNA挽回物应用到LC-MS定性进行分析，我们建设半个种退行纯化方案设计，可从DNA中的还原非你热塑血清质，仅在灯照时使用会表观遗传组接处含有DNA热塑血清质。用TRIZOL生成上色质并的还原被抓获的非热塑血清，随后将其全新融掉以实现RNase助消化酶。使用多普勒彩超分割所得额血清质热塑DNA的生成物，在硫氰酸胍中煮开退行，并在二腐蚀硅离心力柱上激动洗滌以的还原非你热塑血清质终将完整。使用核酸酶进行处理从DNA中放出光热塑血清，并实现胰血清酶助消化酶应用到LC-MS定性进行分析。该策略取名为血清质热塑DNA生成或XDNAX。

图1.脂肪酸质交连DNA生成或XDNAX步骤流程（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可进行遇到DNA的核苷酸质图谱

将光交连方式运用于MCF7神经元，看见了1,805种侯选人淀粉酶，但其中1,191种现实存在于3个或更高次按顺序中。60%的DNA能够 效用组有带核酸紧密联系的GO注脚，在不足核酸紧密联系注脚的淀粉酶质中，较大的业绩源于核纤层淀粉酶，之后是体验印染质组建和神经元裂开的淀粉酶质（图2）。

图2 . 可马上接受 DNA 的蛋清质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3个人小结了DNA互为间目的组所抽象性的血清质-DNA对话框举例说明含有的核苷酸交连肽。这属于根据（1）球状DNA切合实际组成部分域、（2）DNA 切合实际无章区（IDR）和（3）根据与同一血清质（随后组血清切合实际血清）、RNA（随后剪接指数公式）或相分离法区室（随后核仁血清）互为间目的而从而导致的大环境临近。

图3 . 可随便接处 DNA的成分域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、定量分析人体细胞扰动阶段与DNA结合起来的转录因素

雌刺刺的激素多巴胺受体α（ESR1）驻带到胞质溶胶中，甚至问题其配体，触及易位到受损受损神经细胞质，在那处它与什么是基因组中的单一部分紧密结合以促活单一的转录流程。将血清饥饿的MCF7受损受损神经细胞曝露于高用药量雌刺刺的激素（10 nM 17β-雌二醇）4两分钟的时间，与模似加工处理的對照受损受损神经细胞相比二者的DNA主动帮助组（图4A）。这之中，雌刺刺的激素激起后DNA主动帮助组中的ESR1上升了30倍（图4B）。总之一，在1,814个按量的高淀粉酶质-DNA主动帮助中，约有9%界面显示出超越2倍的显著性变迁，并观看到与ESR1体现了主动帮助的高淀粉酶如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌肾上腺素解决乳房增生癌肿瘤细胞 DNA 之间使用组的定量分析相比（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

探索加入dna组的核苷酸质以熟知 它是咋样被写入并付诸实践内容的，直到是科技创新员工一两个短期的要求。dna组可及性重点以DNA为主的弧度实现探索，因此，到现今截止，固色质妇科凝胶中的那些核苷酸质与DNA 发生了物理上的双方能力尚不很清楚。在使用零的距离光交连，可表明DNA双方能力组中的基本都数核苷酸质，XDNAX技术水平将用作核苷酸质-DNA双方能力探索的坚强平台。

拜谱个人心得体会

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球营养物质组学、装饰组学、基础代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

考虑文献综述：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.