
近日,无锡医科综合大学第一个所属医院科室王学浩科学院院士团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向疗法卡路里产生检测分析服务。
日文文章标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
常常副标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
投资者工作单位:南京医科大学
分析涂料:细胞
拜谱出示的服务:转录组测序+球蛋白互作组+靶点激光能量分解组
的技术自驾路线:
科研效果
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的要点表观遗传
本研究探讨收采HCC肿癌样例(n=7)的单癌神经元核RNA测序动态数据信息集通过了解,显示糖酵解活力性最主要的汇集在肿癌癌神经元核中,hdWGCNA了解识别图片出9个基因组模快(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的发展了解断定YBX1为独立性发展安全隐患各种因素(图1H)。进这一步依照IHC、WB实验性和肿癌策划 与毗邻非肿癌策划 的三维空间转录组学动态数据信息集证明YBX1是肝癌神经元核癌治療的潜在性靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被选择为调整HCC神经细胞糖酵解的关健原则
02、YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物养分分解组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1促进会HCC中的有氧糖酵解和繁殖
03、OGT与YBX1相结合并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白酶互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1组合并推进YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提高其磷过酸,然而有助于其核转位
下一部骤论文检测YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以影响到其磷碱化,在OGT敲低的HCC组织中或用OGT治理和改善剂OSMI-1进行治疗,YBX1蛋清质能力正相关降,YBX1磷碱化正相关减掉(图4A-C)。IP实验报告展现,在相等的Flag-YBX1底物能力下,YBX1-WT的磷碱化能力正相关高过YBX1-T57A,发掘磷碱化的曾加这样只是只是是可能高的YBX1蛋清质呈现(图4D)。破乳了核和质混合物发掘TMG进行治疗的HCC组织中YBX1核呈现的提升(图4E-F),下一部骤发掘YBX1磷碱化的要素控制分子是AKT(图4G-I)。这个发掘特别指出O-GlcNAc糖基化实现可以淡化其磷碱化来有助于YBX1蛋清质稳界定性并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 绘制有助于其进几步发生了磷过酸绘制并可以促使其核转位
05、YBX1提高网站PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于促进PKM2转录
06、YBX1 可以延长组血清乳过酸呈现技术水平
实验室遇到YBX1敲低差异性降底胆固醇质乳过酸,特别是在是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解压溶液剂2-DG的实验室表明了糖酵解与组胆固醇乳过酸的会立即关系,压制糖酵解可差异性降底H3K18la横向(图6D)。PKM2过表达出方式可逆性转YBX1敲低而致的H3K18la骤降,之外源乳酸净化处理既发展H3K18la,还陪伴YBX1表达出方式调涨,的提示有着顺向意见反馈(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR表明,H3K18la采用含有于YBX1启用子会立即加快其转录,该的过程 受O-GlcNAc糖基化调整(图6H-J),并遇到P300 调涨是YBX1促进H3K18乳酰化成用的长效机制(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳酸性反应呈现总体水平
经典文章个人心得体会
在一项探讨中宣传报道了YBX1在HCC中高传达,有时候与糖酵解开切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc淡化,可以稳定的蛋白质酶质并提高其传达。各种淡化还有利于提高网站YBX1在T57处的磷酸性反应,有利于提高网站其核易位。这样,这种历程加强了糖酵解一些人类基因组的转录并促进乳酸的行成。与此同时,YBX1修改密码P300的转录,从而驱动器组蛋白质酶的乳酸性反应,越来越是H3K18la,H3K18乳酸性反应正面控制YBX1人类基因组转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因正反两面馈环策略图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物工程为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向疗法养分新陈代谢组技术服务,拜谱动物建立了完善成熟的转录组学、淀粉酶组学、反译后表达组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考虑资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.