
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用遮盖血清组学产品,实现1000+高妙度呈现位点检测,增强逆转原素靶点,全方向生信解析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“挖掘”到“确认”全程序流程产品,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、测试具体流程
02、测量资料
03、经“点”显现
在测评信息中,验出多家文献综述中通讯报道的经典爱情靶点也有衣康酸掩盖位点,如第一次个被看到的衣康酸共价掩盖淀粉酶KEAP1,也有糖酵解通道中的3个要点性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或者炎性小体组合成淀粉酶NLRP3和细胞核死亡的过程中的要点性淀粉酶RIPK3等,其质谱图相应图如下图所示。
04、产品设备显著特点
1.多厚质控
商家化活性聊天电极孵育、SDS-PAGE探测、WB认证、样品想关性分享等各坐向探测,为了保证品牌结论可以信赖性。2.高的性能质谱分析仪器手机平台
在Orbitrap Astral全新第二代高鉴别质谱仪支持下,改变衣康碱化体现位点及核蛋白鉴定会新角度,助推器有效研究方案新显示。3.全具体步骤一坐式服务项目
针对拜谱生物学完美的实验性网站,可能提供“组织细胞训练→查重器孵育→WB查重→艰深度衣康硝化作用呈现查重→专属密码生信阐述→当前位点PRM证实”全的流程功能,省时省劲更放心。05、定量分析玩法(个部分)
06、应用路径
PART 2、文章转发
论文资料一
英语翻译题头:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
汉语题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
探析知识:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
文献资料二
国外英文标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
常常文章标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
钻研文章:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、案例库诞生难点
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼备强些的底物根据力量,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱微生物衣康过酸呈现组场地实测数据显示中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸表达(如下所述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人总结
作TCA无限循环中的里边分解基础代谢转化物,衣康酸调节器分解基础代谢转化、免疫性性检测和细菌感染间的互为用,为制疗免疫性性检测细菌感染性皮肤患病提高了代替品制疗措施。衣康酸结构设计的中的亲电性α,β-不过饱和羧酸结构设计的能对球膳食纤维上的几丁质酶半胱氨酸残基做出烷基化遮盖(迈克尔减伤想法),这样翻译专业后遮盖被称做“衣康酸遮盖(itaconation)”,接着印象球膳食纤维实用功能,监测免疫性性检测对答和分解基础代谢转化渠道,为多个皮肤患病用量研制提高新设想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸绘制蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学专业必然按量靶点新陈代谢组(QMT1000)或正能量分泌靶点分泌组商品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
参阅文章
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.