
2024年9月由东莞绿植基地读书张万刚专家团队协作在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化呈现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
2英文标题文字:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202多年印象细胞因子:5.7
发表论文周期:2024年9月
投资者公司的:南京农业大学
分析原材料:蛋白
拜谱出示系统:亚硝基化修饰组学
系统自驾路线:
一、分析成果
01.Caspase-3活力
现今尚不看清楚NO对caspase-3的减缓帮助是不是也归因于NO介导的S-亚硝基化,其他浓度值系数的GSNO为外源性NO批发商,以成脂caspase-3的身体之外S-亚硝基化。报告单体现了,与没了GSNO的组不同之处,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化特殊大大减少(图1),与仍然通讯稿共同。GSNO处里大大减少caspase-3化学活化的潜在的原故仍尚待系统阐述。
图1 有所差异盐浓度的GSNO操作对caspase-3活性酶类的决定
02.Caspase-3的S-亚硝基化层度
科研Caspase-3的亚硝基化阶段,以具体分析GSNO对Caspase-3的发生的反应性。经GSNO操作后,检验到caspase-3核蛋白S-亚硝基化強度增大(图2)。这样效果阐明,外源性GSNO养育可成功的诱导性caspase-3的离体S-亚硝基化。令人感动难以相信的是,在都没有GSNO会出现的照表组中检验到一款 暗淡的S-亚硝基化带,这阐明caspase-3几率发生的内源性的S-亚硝基化。前者,本科研中caspase-3的S-亚硝基化阶段较高,而caspase-3的几丁质酶影响,这与在之前的科研不一样。但,caspase-3的特男人S-亚硝基化绘制位点尚不明确,还需进一大步的探索性。
图2 GSNO处置对caspase-3S-亚硝基化技术的会影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化装饰组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码编码序列。蓝色系标上的编码编码序列觉得S-亚硝基化肽,橙红色标上的C觉得S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3可降解结核蛋白
结蛋清酶身为属于为重点的体内部骨架蛋清酶,在提升肌体内部框架的框架完正性和做收缩性层面起着为重点用途,研究方案S-亚硝基化caspase-3对结蛋清酶分解的比较敏主观享有为重点积极意义。与Std(未用胱天蛋清酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌棉植物纤维蛋清酶)组相信,0 μM GSNO组(肌原棉植物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完正结蛋清酶占比更为比较突出降底,警告caspase-3对结蛋清酶享有风险的蛋清酶油脂水解性能。在GSNO孵育后,完正结蛋清酶的占比比较突出加剧(P < 0.05)。还有就是,当GSNO酸度偏高时,完正结蛋清酶的占比定期上浮(P < 0.05)(图5)。一种遇到是因为,SNO淡化的caspase-3以技术根据的手段可以抑制结蛋清酶的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3化学降解结蛋清
05.S-亚硝基化Caspase- 3化学降解肌钙血清-T
肌钙核血清-T (TnT)是原肌球核血清的转换担任腹肌紧缩的细条的有必要肌原玻纤核血清。TnT的挥发结构特征是探测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化水平下,caspase-3对TnT的挥发情形如6如图是,与Std组(不添加caspase-3和GSNO的肌原玻纤)比起,caspase-3组中30 kDa TnT精彩精彩片段有效添加,证实caspase-3组织了TnT的挥发,除此之外,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT调低。在100和200 μM GSNO组间是没有探测到分明的差别的(P > 0.05),而当GSNO的浓度值起到400 μM 时,该精彩精彩片段有效避免(P < 0.05)。以上看到证实了SNO遮盖语的caspase-3对TnT挥发的仰制作而成用。结核血清和TnT是caspase-3的敏感度底物,而GSNO净化处理调低caspase-3的灵催化活性有机会造成的肌原玻纤核血清挥发意识调低。结合以上表明,NO引导的S-亚硝基化能够 采用遮盖语半胱氨酸残基来的转换caspase-3的灵催化活性,转而进那步应响其对结核血清和TnT的核血清油脂水解意识,可以应响牛肉片产品质量。
图6. S-亚硝基化caspase- 3生物降解肌钙血清-T
二、总结
本研发亟需浅析S-亚硝基化对caspase-3表达的反应举例随着对牛羊肉肌原人造植物纤维休外分解的反应。球淀粉酶S-亚硝基化可表达caspase-3的半胱氨酸残基,以此使得caspase-3渗透性调低,进一个步骤限制了其对牛羊肉肌原人造植物纤维球淀粉酶的球淀粉酶淀粉水解程度。三、拜谱总结ppt
理论探讨用于了酶活加测法,亚硝基化绘制组学剖析,WB等加测具体方法,表明淀粉酶S-亚硝基化可能绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这造成了caspase-3抗逆性的较低,相结一大步减缓了其对鸡肉肌原玻璃纤维淀粉酶的淀粉酶淀粉水解效果。本理论探讨为回答淀粉酶质亚硝基化对肉肥的调节作用机理带来半个个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的营养素质组学、掩盖营养素质组学、分泌组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸类型企业产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total阳极氧化修复、游离于巯基,欢迎大家咨询!
关联性资料:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663