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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗原动物群特男人、寡核苷酸遮盖成本费用比较高或操作程序程序很复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯专家教授团队合作在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低的成本、跨种群、全网站兼容的全新解决方案。

期刊论文简价

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由中华生态学学有效院基因遗传规律的基因的与发育期海洋分子结构生态学学探析所和中华基因遗传规律的基因的学习主办者的國际学界刊物,倾力于简讯灵魂生态学学有效和分子结构生态学学基因遗传规律的基因的学域的原创视频性探析工作成果。JGG 202多年度作用分子结构7.1,Scopus学界刊物评测评价指标CiteScore 9.9,榜排JCR 202多年度GENETICS & HEREDITY域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY域Q1区,榜排中华生态学学有效院刊物区分海洋分子结构生态学学大类目1区(Top刊物),基因遗传规律的基因的学和什么是生化与分子结构海洋分子结构生态学学小类双1区。

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啥是HEATag

巧用的“二合为一体”构思

HEATag是由凝集素和HUH内切酶结构的融和蛋白酶

「位置器」信息模块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「拼接器」引擎 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)数据库索引长形码做出共价接触。

“1+1>2”的效果好:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样表符号与朔源。

Fig1: HEATag多沉标识方式举手图

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实战技巧考察

HEATag不懈有多用打?

就能够在不一样条件下,变现母乳喂养节肢动物体细胞膜系单体细胞膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研公司为 HEATag 配置了多轮 “有压力测评”,从人体血细胞系到人体血细胞结构,从恒温到低温环境,从新鲜模本到统一模本,全八卦方位认证它的安全稳定义和耐用性。

1轮考试采取乳期甲壳动物肿瘤生殖上皮细胞系:探析人群考虑了来源人、鼠、仓鼠3个外来动物群的五种肿瘤生殖上皮细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在制冷使用 HEATag 图标后混和测序。结果回收处理的 11447 个肿瘤生殖上皮细胞中,85.66% 都能根据 HEATag 长形码更准匹配好到原外来动物群,样例间交叉点环境破坏稀少,UMAP 聚类具体分析具体分析是会直接证明怎么写,HEATag 长形码与外来动物群特男人什么是基因组结构特征极高不同。 接下来,测验前提进第一步晋级:探讨考生试试在 4℃下标志生鲜度神经人体血人体細胞、在在常温下标志甲醇统一神经人体血人体細胞,甚至会直接性标志神经人体血人体細胞质。毕竟显示即使显眼:其它前提下,模本价签与外来物种数据均享有有效的一些性,分拆更成功率超 95%。倘若甲醇统一会诱发中度的转录本相交污染源,神经人体血人体細胞质配制老有小量 RNA 损失,神经人体血人体細胞型号的注解毕竟显示即使与生鲜度模本实现不对,證明 HEATag 能能标志有差异处理前提下的实验报告模本。

Fig2: HEATag 可在不同的情况下成功单内部转录组混样研究

就能够标记图片辅乳動物和深海无脊椎骨動物的原代血细胞

假若说肿瘤人体细胞系检测是 “基本题”,那阻止样品也是 “额外增加题”, 等等样品一般情况下因肿瘤人体细胞方式有难度、坏境自我调节性专项 ,被选为符号技术应用的 “困难”,而 HEATag 恰恰舞在等等 “困难” 上塑造了优劣势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织化,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不光能被准确的辨认,很多注意组织类的聚类算法最后都明晰可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海域怪物的匹配性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与动物群转录组具备有较高同一性,并没有出現因高盐周围环境导致的 “标记图片不能正常工作”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可实现了辅乳各种动物组织安排样例多种 scRNA-seq 分析一下

Fig4: HEATag可改变新鲜度海洋能无脊椎骨节肢动物多个 scRNA-seq 进行分析

HEATag与组织细胞的融合不易引发转录组的相关性修改

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在完整标上工作的一同,没有对事件调查的转录类物质析出现扰乱,保障了学习数据分析的完美性。

Fig5: HEATag都不会印象样例的 RNA 表现格局

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未来生活可期

HEATag 能为单内部深入分析受到怎样的?

HEATag 的商业价值,远不已于 “满足标志难题”,它的机灵性和普遍意义,已经在为单受损细胞探索点击更好地机会性

从APP行业应用来说

HEATag 能复盖从 “简洁对比定量分析”(如癌进行与常见进行、类药治理 与对应)到 “工业化化理论研究探讨”(如进行体组织图谱绘制图、高通芯片量挑选)的全依据要。发生变化 PIP-seq、Stereo-cell 等新型的可扩充系统的发展前景,HEATag 还能进一部加强单体组织理论研究探讨的通量,力助科研课题技术团队开发更工业化化的品牌。

从跨邻域有潜力来谈

HEATag 不但广泛用于于转录组学,还能与表观基因组组学、血清质组学、未来发展空间组学等技艺结合在一起,确认定做检索和寡核苷酸回文序列,HEATag 能够容易溶入有差异 的组学流量,不应响预警抓取深入。时候,为HEATag还能够未来发展单血细胞糖组学学习技艺。

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合作方式静态

拜谱海洋生物与陈凯教学取得开始协作意愿

值当加关注的是,在 HEATag 方法展示出出强大APP软件空间的游戏 背景下,拜谱菌物技术高的技术已与我国南部大海科学合理与工程施工惠州市进行实验英文室(郑州)陈凯院士获得初阶段合作的意愿。双方彼此预计强调 HEATag 方法的产业发展化落地式、研发还原成等趋势绘制深度.协同作战,促进改革该低的成本、跨动物群的单人体组织癌细胞图标方法速度更快APP软件于现实的研发消费场景,为许多进行实验英文室带来了快速、社会经济的单人体组织癌细胞钻研设备,保驾护航研发本职工小编在人体组织癌细胞菌物技术高的技术学、大海菌物技术高的技术学、症状规则等各个领域获得许多挑战
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